Đoàn Thanh tra sẽ tiến hành thanh tra trong thời hạn 10 ngày kể từ ngày công bố quyết định thanh tra. Nội dung thanh tra chủ yếu tâp trung vào việc thực hiện nhiệm vụ chuyên môn, công tác tổ chức, cán bộ, tài chính ngân sách, phòng chống tham nhũng và thực hành tiết kiệm,chống lãng phí.